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安徽医科大学临床医学院是2003年由安徽医科大学创建，是经国家教育部和安徽省人民政府批准设立的独立学院；是安徽省纳入第二批本科录取的全日制普通高等教育本科院校。1926年5月，郭琦元、汤蠡舟等在上海市原亚东医科大学的校址上（上海市沪军营）创办上海东南医科大学（安徽医科大学前身）。1952年迁至省会合肥市现址，更名为安徽医学院。1985年更名为安徽医科大学。2003年经国家教育部和安徽省人民政府批准，由安徽医科大学第一附属医院投资，安徽医科大学与安徽医科大学第一附属医院合作举办，在合肥市经开区翡翠路15号创建了安徽医科大学临床医学院，目前学校总体占地面积1379亩。
